Revista de genética y mejoramiento vegetal

Abstracto

Una población mutante de neutrones rápidos en la variedad de arroz modelo KitaakeX y su uso para facilitar la genética directa e inversa

Rashmi Jain

La variedad Kitaake (ssp. japonica) ha emergido como un modelo para la investigación del arroz. Es un cultivar de arroz de floración extremadamente temprana, fácil de propagar, con buen potencial de rendimiento y calidad comestible. Aquí, informamos sobre la secuenciación y análisis de novo del genoma de KitaakeX, una variedad de Kitaake que porta el receptor inmunológico XA21. Nuestro ensamblaje de secuencias KitaakeX contiene 377,6 Mb, que consiste en 33 estructuras (476 contigs) con un contig N50 de 1,4 Mb. El ensamblaje se complementa con anotaciones genéticas detalladas de 35.594 genes codificadores de proteínas. Identificamos 331.335 variaciones entre KitaakeX y el genoma de referencia Nipponbare (ssp. japonica), y 2.785.991 variaciones entre KitaakeX y Zhenshan97 (ssp. indica).