Revista de técnicas analíticas y bioanalíticas

Abstracto

Caracterización de la red de interacción proteica de Clostridium acetobutylicum a partir de la fermentación del butanol

Kumaran Sivagnanam, Vijaya GS Raghavan, Manesh Shah, Robert L Hettich, Nathan C Verberkmoes y Mark G Lefsrud

La producción industrial exitosa de butanol requiere un conocimiento profundo de Clostridium acetobutylicum . El desarrollo de enfoques computacionales para estudios de interacción de proteínas nos permitió generar una red de interacción de proteínas predicha de C. acetobutylicum ATCC 824. En este estudio, se identificaron más de 400 proteínas de C. acetobutylicum durante la fermentación de butanol utilizando proteómica shotgun y de solo 217 proteínas, predijimos 1947 interacciones. Este análisis mostró que las proteínas de C. acetobutylicum forman una red altamente interconectada y se encontró que las principales funciones representadas eran la síntesis de proteínas, el metabolismo de carbohidratos y el metabolismo de butanoato. Además, utilizamos estos datos de interacción para analizar el enriquecimiento de los términos y vías de ontología génica en C. acetobutylicum. Nuestro análisis reveló que los procesos biológicos como la traducción, el proceso metabólico de proteínas celulares, el proceso biosintético y las vías que incluyen la glucólisis y el metabolismo de butanoato se enriquecieron significativamente en C. acetobutylicum durante la fermentación de butanol. Este estudio proporciona una nueva perspectiva de los mecanismos funcionales de C. acetobutylicum a nivel de red, complementando el conocimiento actual en relación con este organismo de importancia industrial.