Revista de genética y mejoramiento vegetal

Abstracto

Nivel de diversidad de microsatélites genómicos en el laurel rojo (Perseaborbonia L.) generados mediante secuenciación de Illumina

Haiying Liang, Chien-Chih Chen

El laurel rojo, Perseaborbonia (L.) Spreng., es un árbol o arbusto perenne común nativo de los bosques pantanosos de las llanuras costeras del Atlántico y del Golfo en los Estados Unidos. En la última década, las poblaciones de laurel rojo han sufrido una gran mortalidad causada por la enfermedad vascular marchitez del laurel (Raffaelealauricola Eichhoff), que se ha propagado por el exótico escarabajo ambrosía del laurel rojo (Xyleborus glabratus Eichhoff). La enfermedad está amenazando las funciones económicas, ecológicas y estéticas del laurel rojo. Los primeros esfuerzos para preservar la diversidad genética de la especie amenazada, a través de la recolección de semillas y propágulos vegetativos, se han realizado sin el beneficio de la orientación de una caracterización molecular de la variación genética existente. Los marcadores moleculares pueden resultar útiles para guiar los esfuerzos de conservación eficientes para esta especie. Aquí examinamos 51 marcadores de microsatélites genómicos (gSSR) derivados de la secuenciación del genoma completo de baja cobertura del laurel rojo con un panel de 25 árboles de laurel rojo no relacionados del este de Carolina del Sur. Cuando se analizaron en un analizador genético ABI 3730, 24 marcadores demostraron puntuaciones altamente informativas con un contenido de información polimórfica de al menos 0,50 y una frecuencia de alelo nulo estimada ≤0,1. El número medio observado y efectivo de alelos de estos 24 sSSR fue de 5,29 y 3,06, respectivamente. La heterocigosidad observada varió de 0,17 a 1,00 con una media de 0,65, mientras que la heterocigosidad esperada varió de 0,16 a 0,90 con una media de 0,62. La heterocigosidad esperada de Nei y el índice de información de Shannon fueron 0,60 y 1,17, respectivamente. Estos resultados indican un alto nivel de diversidad en los 24 marcadores gSSR del laurel rojo. Este es el primer informe de variación genética de los marcadores de ADN del laurel rojo. Los gSSR que exhiben altos niveles de polimorfismo se pueden aplicar en la caracterización de la composición genética y la diversidad de la colección de semillas y los genotipos resistentes en programas de conservación y mejoramiento de germoplasma del laurel rojo.