Bioquímica y fisiología: acceso abierto

Abstracto

Análisis in silico de elementos reguladores CARE que actúan en cis en regiones anteriores de genes de la vía del ascorbato y el glutatión de Oryza sativa

Saurabh Pandey, Chinreddy Subramanaym Reddy, Ubaid Yaqoob, Yogesh Kumar Negi, Sandeep Arora y Tanushri Kaul

Los CARE desempeñan un papel importante en la tolerancia al estrés de las plantas al interactuar con factores de transcripción y controlar la expresión de muchos genes potenciales relacionados con el estrés. El reconocimiento de promotores y sus elementos reguladores es uno de los desafíos cruciales en biotecnología. En este estudio, examinamos el elemento regulador que actúa en cis en las regiones 5' aguas arriba (~1 kb) de los genes de la vía Asc-Glu como SOD, APX, MDHAR, DHAR y GR. Las relaciones evolutivas entre estas secuencias se descifraron utilizando MEGA v. 6.0. La región promotora de estos genes contiene varios elementos reguladores que actúan en cis como MBS, repetición DRE/C, caja W, HSE, elemento TCA, LTR, caja ABRE, caja ARE, Wun y DRE que tienen un papel significativo en la tolerancia al estrés. El análisis de las secuencias promotoras de Asc-Glu reveló su capacidad de respuesta específica o superposición en varios tipos de estrés ambiental y contribuye significativamente al crecimiento y desarrollo de las plantas.