Bioquímica y fisiología: acceso abierto

Abstracto

Identificación de epítopos para el diseño de vacunas y aspectos estructurales de la proteína de envoltura del virus del dengue 3

Arun G. Ingale

El dengue es una de las enfermedades virales emergentes transmitidas por vectores más importantes. Un problema importante en el diseño de vacunas contra el virus del dengue ha sido la alta variabilidad antigénica en la proteína de envoltura de diferentes cepas del virus. Para fomentar vacunas operativas es esencial dirigirse a múltiples componentes antigénicos del virus, enfocando así el sistema inmunológico para proteger al huésped del virus. En consecuencia, es esencial estudiar las características estructurales y funcionales de esta proteína de envoltura DENV3 en la detención de la enfermedad. El propósito de este estudio fue la caracterización estructural in silico de la proteína de envoltura DENV3 y predecir sus determinantes antigénicos. Este esfuerzo representa el primer estudio de predicción estructural y de epítopos de la proteína de envoltura DENV3 de origen indio. Se realizaron análisis computacionales y se generó un modelo de homología de la proteína de envoltura DENV3. La calidad del modelo se evaluó mediante PROCHECK, VERRIFY-3D, PROSA y Errat. Los resultados indican una calidad general del modelo predicho del 89,88% con una puntuación Z de -4,67. La estructura del modelo se envió finalmente a la base de datos de modelos de proteínas. Los resultados del servidor MetaPocket predijeron los sitios de unión, que son buenos y útiles para el propósito de acoplamiento. El análisis reveló epítopos de células B y CTL conformacionales confiables que pueden promover la respuesta inmunitaria deseada contra el virus del dengue. Esta información también puede ayudar en el diseño de vacunas contra el dengue en caso de deficiencia de estructuras resueltas experimentalmente.