Revista de Bioquímica y Biología Celular

Abstracto

Expresión genética de clones A549 derivados del adenocarcinoma de pulmón humano

Sadhwy S

Para aclarar las interacciones entre genes y proteínas, GenSensor Suite consta de cuatro herramientas web. Los resultados de GenPath revelan si las categorías de genes bioquímicos, reguladores u otros están sobrerrepresentados o subrepresentados en una lista de entrada en comparación con una lista de antecedentes. GenPath incluye algunos conjuntos de genes específicos además de todos los conjuntos de genes comunes que se pueden buscar. Los usuarios pueden incluir listas de antecedentes únicas. GenInteract crea una lista de genes de interacción a partir de un solo gen de entrada y luego usa GenPath para evaluarla. Para extraer una lista de genes de una lista de identificadores de PubMed y consultarla en GenPath, GenPubMed emplea una consulta de PubMed para encontrar la lista de identificadores de PubMed. Los usuarios de GenViewer pueden comparar un conjunto de genes con otro en GenPath. Para curar tejido pulmonar dañado o irreparable, el tratamiento con células madre parece prometedor. Sin embargo, debido a que el mecanismo molecular subyacente a la diferenciación de las células epiteliales alveolares no se conoce por completo, desarrollar una metodología sencilla y repetible para las poblaciones progenitoras pulmonares es un desafío. Utilizando la línea celular epitelial alveolar humana tipo II A549, examinamos un sistema in vitro para examinar los mecanismos de control de la expresión génica específica del alvéolo. Se clonaron subpoblaciones A549 y cada clon se dividió en cinco categorías según la morfología celular y la expresión génica del marcador. B7 y H12, dos clones, se sometieron a un examen adicional. La proteína surfactante C, un marcador ATII, aumentó tanto en H12 como en B7 cuando se cultivaron en un entorno sin suero. Un marcador ATI conocido como acuaporina 5 (AQP5) estaba altamente elevado en B7 y H12, respectivamente.