Revista de genética y mejoramiento vegetal

Abstracto

Identificación y caracterización de la familia de genes de la superóxido dismutasa (SOD) en B. juncea y B. rapa y su respuesta al estrés abiótico

Deepika Verma

El estrés produce especies reactivas de oxígeno (ROS) que dañan el crecimiento y desarrollo de las plantas y reducen la productividad de los cultivos de colza y mostaza (Brassica). En el pasado se han hecho esfuerzos para identificar las familias de genes que ayudarán a proporcionar resistencia contra estos estreses. Las SOD constituyen la primera línea de defensa contra las ROS que catalizan la reacción de dismutación O2- + 2H+→O2+ H2O2. La clasificación según sus cofactores metálicos distingue a las SOD en tres clases: Cu-ZnSOD, MnSOD, FeSOD. El presente estudio informa sobre la identificación de genes SOD en todo el genoma que arrojó un total de 29 y 18 en B. juncea y B. rapa. Las coordenadas genómicas de los genes BjuSOD se obtuvieron de BRAD y el mapeo se realizó a través del software MapInspect. La clasificación filogenética se basó en la composición de su dominio, que también fue respaldada por predicciones de ubicaciones subcelulares. La anotación genética de los genes SOD se realizó a través de BLAST2GO. El análisis de expresión bajo estrés abiótico se realizó a través del software Trinity y los candidatos se validaron bajo estrés por calor y sequía en plantas B. juncea y B. rapa mediante qRT-PCR. Los elementos cis-reguladores predichos en los genes BjuSOD respaldaron los datos del análisis de expresión. Se predijeron con éxito un total de 10 y 14 genes SOD sensibles al estrés abiótico en B. juncea y B. rapa respectivamente. Nuestro estudio ayudará a proporcionar información significativa de la familia de genes SOD sensibles al estrés abiótico que actuaría como un recurso potencial para la mejora de la resistencia al estrés en cultivos de Brassica.