Biología celular y molecular

Abstracto

Identificación de un nuevo gen de proteína de membrana tipo canal de cloruro activado por calcio (Ca2+) que codifica el motivo de metaloproteasa en Xenopus laevis

Lee RM, Han JS y Jeong SM

En este trabajo, informamos sobre la clonación e identificación de un gen de proteína de membrana tipo canal de cloruro activado por calcio (Ca2+) (CLCA) 1 (CMP1) del colon de Xenopus laevis, que codifica un motivo de metaloproteasa. CMP1 se identificó mediante análisis in silico, amplificación rápida de extremos de ADNc (RACE) y análisis de distribución tisular. Se reveló que la secuencia de aminoácidos de CMP1 mostró una identidad general del 49,8% con CLCA1 de cerebro de rata (rb) mediante análisis in silico. En particular, se adaptaron los métodos 5'- y 3'-RACE para obtener la secuencia completa de ADNc con un marco de lectura abierto (ORF) que codifica 936 aminoácidos. CMP1 también tenía las siguientes características de los miembros de la familia CLCA: secuencia de señal predicha (ss), glicosilación ligada a N, N-miristoilación, fosforilación por PKC y caseína quinasa II con al menos cinco dominios transmembrana (TM) putativos. Además, se reveló que CMP1 se expresa de forma ubicua, especialmente en el cerebro, el colon, el corazón, los riñones, los ovocitos y el bazo, tanto con análisis de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con transcripción inversa (RT). ) semicuantitativa como con análisis de PCR en tiempo real. Los tejidos, excepto el cerebro, el corazón y el bazo, tenían una expresión de CMP1 relativamente baja, y la expresión era casi indetectable en el pulmón y el intestino delgado. En particular, no pudimos detectar CMP1 en el hígado. En conjunto, estos resultados mejoran la cantidad de información genética disponible para X. laevis y fueron útiles para caracterizar a CMP1 como una posible metaloproteasa en lugar de un canal iónico.