Bioquímica y fisiología: acceso abierto

Abstracto

Estudios de unión de ligandos in silico y en solución de lectina de Cicer arietinum

Madhurima S. Wakankar, Krunal A. Patel, Musti V. Krishnasastry y Sushama M. Gaikwad

La lectina recombinante de Cicer arietinum (rCAL) mostró una especificidad de azúcar compleja y pudo unirse solo al glicano triantenario asialo de Fetuina. El estudio termodinámico de la unión a este glicano indicó que el proceso era espontáneo y exotérmico. Los valores obtenidos fueron, ΔG como -28,56 kJ mol ^-1 ; ΔH como -43,65 kJ mol ^-1 y ΔS como -50,65 Jmol ^-1 K ^-1 a 25 °C. La presencia de cuatro dominios de unión a hemopexina en la secuencia del gen indicó una posible unión a la hemina. La unión de la hemina estudiada por espectroscopia de fluorescencia produjo una constante de asociación de 3,55 x 107 M ^-1 . La lectina también se unió a la espermina y la tiamina con constantes de asociación de 1,55 x 104 M ^-1 y 5,37 x 103 M ^-1 , respectivamente. Se llevó a cabo una investigación in silico mediante el acoplamiento proteína-ligando utilizando el software AutoDock Vina. Se calcularon las energías de enlace para cada ligando y se identificaron los aminoácidos involucrados en la interacción de estos ligandos con el modelo de homología rCAL. Se descubrió que el residuo ASN-8 era importante en la unión de la hemina y la espermina a rCAL.