Revista de investigación de inmunología de las mucosas

Abstracto

La identificación de una matriz de expresión de orden completo destaca las variaciones en los genes de defensa de la membrana en el carcinoma del conducto de Barrett y del conducto de Barrett

Blake Jones

La enfermedad neoplásica maligna esofágica (EAC) se ha convertido en una gran preocupación en los países occidentales debido a los rápidos aumentos en la incidencia además de las tasas de supervivencia muy bajas. Uno de los factores de riesgo clave para el desarrollo de este cáncer es la presencia del desfiladero de Barrett (EB), que se cree que se forma en respuesta al reflujo gastroesofágico perenne. En este estudio, tenemos una tendencia a realizar una identificación de expresión comparativa de todo el genoma (utilizando Beadarrays de genoma completo de Illumina) en el ácido ribonucleico total extraído de los tejidos de ensayo de diagnóstico de estructura muscular de individuos con EAC, EB (en ausencia de EAC) y personas con tejido animal escamoso antiguo. Tenemos una tendencia a combinar estos datos con datos de acceso público de tres estudios similares para investigar las variaciones clave de secuencia y filosofía entre estos tres estados de tejido. Los resultados respaldan la deducción de que el EB puede ser un tejido con una maquinaria de síntesis proteica exagerada (DPP4, ATP2A3, AGR2) diseñada para proporcionar defensas de membrana duraderas destinadas a resistir el reflujo gastroesofágico. El EAC exhibe los efectos mejorados de remodelación de la matriz de objetos físicos (colágenos, IGFBP7, PLAU) esperados en el cáncer de pulmón agresivo, así como evidencia de una expresión reducida de genes asociados con las defensas de membrana (MUC6, CA2, TFF1) y xenobióticos (AKR1C2, AKR1B10) una vez que nuestros resultados se comparan con estudios previos de identificación de expresión de genoma completo; los grupos de secuencias de escleroproteína, mucina, anexina y factor trebol son las familias de secuencias expresadas diferencialmente pintadas con mayor frecuencia. Once genes conocidos aquí están pintados durante al menos 3 estudios de identificación completamente diferentes. Tenemos una inclinación a utilizar estos genes para discriminar entre tejido animal escamoso, BE y EAC entre las dos cohortes más grandes utilizando un análisis de validación cruzada de máquina de vectores de soporte (LOOCV), mientras que este método fue satisfactorio para discriminar tejido animal escamoso y BE, demuestra la necesidad de investigaciones cuidadosas adicionales sobre los cambios de identificación entre BE y EAC.