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La contaminación marina se produce cuando los efectos nocivos o potencialmente nocivos resultan de la entrada al océano de productos químicos, desechos industriales, agrícolas y residenciales, el ruido o la propagación de organismos invasores y de fuentes difusas como escorrentías agrícolas, desechos arrastrados por el viento y polvo.
Muchas sustancias químicas potencialmente tóxicas se adhieren a partículas diminutas que luego son absorbidas por los animales del plancton y el bentos, la mayoría de los cuales se alimentan de depósitos o por filtración. De esta manera, las toxinas se concentran hacia arriba dentro de las cadenas alimentarias del océano. Muchas partículas se combinan químicamente de una manera que reduce enormemente el oxígeno, lo que hace que los estuarios se vuelvan anóxicos.
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