Investigación sobre el arroz: acceso abierto

Abstracto

Identificación de genes de biosíntesis sensibles a la sal en arroz mediante análisis de microarrays

Chang-Kug Kim, Hyeon-So Ji, Hak-Bum Kim, Doh-Won Yun, Gang-Seob Lee, Ung-Han Yoon, Tae-Ho Kim, Dong-Suk Park, Young-Joo Seol y Yong-Jae Won

Utilizamos un proceso de selección múltiple para identificar genes involucrados en la biosíntesis y el metabolismo específicos de la tolerancia a la sal en el arroz (Oryza sativa L.). Seleccionamos 8275 genes candidatos relacionados con la tolerancia a la sal utilizando perfiles de expresión generados en cuatro etapas en un microarreglo que contiene 135 000 sondas (microarreglo de 135 K) en Oryza sativa. Utilizando nuestro método, seleccionamos 342 genes ortólogos y 74 genes de vías asociadas con la biosíntesis relacionada con la respuesta a la sal. Finalmente, identificamos seis genes mediante la comparación de genes de la red de vías y genes ortólogos. Los seis genes se anclaron a los cromosomas del arroz para caracterizar sus posiciones en el mapa genético y se utilizaron para construir el árbol filogenético. Los resultados se verificaron mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa.